ترتكز إستراتجية تطوير قطاع النقل البحري والموانئ البحرية التجارية خاصة على المحاور التالية:
- تطوير الأسطول الوطني البحري بتشجيع الإستثمار في وحدات حديثة ملائمة لحركة الملاحة البحرية الوطنية والدولية وذلك للترفيع في نسبة مساهمته في نقل المبادلات التجارية.
- ملائمة وتطوير البنية الأساسية المينائية لمتطلبات الإقتصاد الوطني من خلال إحكام إستغلال البنية الأساسية المينائية الحالية وإنشاء بنية جديدة تتلائم مع التحولات التي يشهدها قطاع النقل البحري والموانئ.
- تبسيط الإجراءات الإدارية والمينائية وإستعمال التكنولوجيات الحديثة وشبكات الإتصال وتبادل المعلومات الإلكترونية
- تحيين وتطوير الإطار القانوني
- تطوير المهن البحرية والمينائية وإحداث مهن جديدة
- ملائمة وتطوير التكوين البحري والمينائي حسب متطلبات السوق
- دعم قواعد السلامة والأمن والمحافظة على المحيط البحري